电子政务网站设计的分析主要包括目标分析和需求分析，通过分析工作可以明确网站运行的目标和重点所在，了解政府工作人员和社会公众对网站的期望，并借此增强网站系统用户与网站实施团队的沟通。
IA（Information Architecture）信息构建理论为电子政务网站设计提供理论支持和方法指导。电子政务网站设计主要包括面向网站信息内容的信息结构设计、面向网页版面的网站可视化设计及面向网站系统运行后台的数据库设计三个方面的工作。
电子政务网站的信息结构设计是网站开发的重点，它直接影响到电子商务的运转。电子政务网站的信息结构设计除了直接与网页的版面和多媒体设计有关外，还应与网站开发的技术相关联，尤其是目前电子政务网站中的内容资源不光是一些静态网页，更多的是以交互方式出现的动态网页，这些信息资源是保证电子政务正常运转的前提，是吸引用户之所在。
网站页面的可视化设计确定整个网站风格的统一，主要包括页面布局结构设计、页面色彩搭配设计、页面字体风格设计、页面栏目风格设计及网站页面的尺寸、整体造型、段落文本、多媒体素材等方面的处理方法和原则确定等。
后台数据库系统是存取网站信息、处理政府业务的重要支撑系统。数据库设计的好坏直接影响到前台信息发布和业务处理的效果。关系数据库系统是网站数据库的主流选型，关系数据库设计主要须考虑数据冗余和数据规范化等因素，E-R图（Entity Relation Diagram，实体关系模型图）是关系数据库设计时经常采用的方法。